Довольно большая часть фамилий с балтийской основой образована от древне-литовских и древне-латышских имен и прозвищ. Фамилия Вайчеконис предположительно образовано от имени Вайчек — фонетического варианта польского мужского имени Войцех, которое переводится как «тот, кто приносит утешение и силу войску».Покровителем этого имени является святой Войцех. Он был священником, миссионером, который способствовал развитию латинской письменности и, возможно, был автором самого старого чешского церковного гимна: «Hospodine, pomiluj ny» («Господи, помилуй нас»). Войцех при жизни пытался искоренить языческие обычаи, к которым относились торговля рабами, многоженство, кровная месть. Историки не исключают возможность, что он мечтал об отделении церкви от государственной власти.Вероятно, основатель рода Вайчеконис был этническим славянином, переехавшим в Прибалтику. Не исключено, что фамилия Вайчеконис возникла в период существования Речи Посполитой — польско-литовской унии, когда контакты между балтами и славянами были особенно интенсивны.
