Фамилия Меомутли имеет довольно интересную историю происхождения и относится к распространенному типу эстонских фамилий.Первая часть фамилии Меомутли восходит к эстонскому слову mao – «желудочный», «змеиный», либо к mee – «медвяный, медовый, медоносный, пчелиный». Вторая же часть фамилии образована от слова mutt – «крот», «старуха», либо от muutlik – «изменчивый, непостоянный».
Ряд старинных русских родов претендует на западноевропейское происхождение, основываясь на фантастических генеалогиях, какие были особенно в моде в XVII в. и до сих пор приводятся иными недостаточно критичными авторами. Тем не менее, для некоторых фамилий эстонского происхождения этимология устанавливается с несомненной подлинностью.