Основой фамилии Никишенков (-а) послужило церковное имя Никита. Мужское имя Никита пришло в русский язык из греческого и означает «победитель». Святым покровителем имени является преподобный Никита Исповедник. Будучи игуменом обители Мидикийской, он исповедовал людей, очищая их души от грехов, проповедуя истинные ценности и христианскую веру. Основой для фамилии послужила просторечная форма имени Никита — Никиша. Вероятно, основатель рода Никишенковых был человеком из простого сословия. Дело в том, что фамилии, образованные от полной формы имени, имела в основном социальная верхушка, знать, или семьи, пользовавшиеся в данной местности большим авторитетом, представителей которых соседи уважительно звали полным именем, в отличие от других сословий, звавшихся, как правило, уменьшительными, производными, обиходными именами.Скорее всего, фамилия Никишенков (-а) изначально возникла на территории Украины или Белоруссии, о чем свидетельствует характерный суффикс -енко. Со временем, вероятно, род Никишенко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов.
