Отличительной особенностью польских фамилий является то, что довольно большая часть из них была заимствована из немецкого или через немецкий язык, а также из литовского и латышского языков. Таким образом, не все польские фамилии образованы от польского корня. Фамилия Флигинский образована от прозвища Флиг (Флиге), которое имеет немецкие корни. По одной из версий, это прозвище восходит к глаголу fliegen - «летать, стремительно нестись». Исходя из этого, можно предположить, что основатель рода Флигинских был проворным, возможно, торопливым человеком, быстро ходил или бегал. Согласно другой гипотезе, в основе этого прозвища лежит слово Fliege - «муха», «мушка (у охотничьего ружья)». В таком случае прозвище Флиге мог получить человек, чем-либо напоминавший муху (например, назойливый или невысокий), либо меткий стрелок, охотник. Флиг, со временем получил фамилию Флигинских. Впервые употребление фамилий в Польше зафиксировано примерно в XV веке, причём исключительно в среде польского дворянства — шляхты. Использование фамилий постепенно распространилось и на другие социально-этнические группы: на горожан (в конце XVII века), затем на крестьян и — в середине XIX века — на евреев.
